深度学习的动物行为跟踪技术平台(DeepBhvTsTM)
Deep learning Animal Behavior tracking system(DeepBhvTsTM)
深度学习的动物行为跟踪技术平台
基于深度学习和机器视觉,可以高精度地对自由移动的实验动物,进行单个或多个身体部位的无标记跟踪。识别动物的姿势,检测和量化行为数据,客观的评价动物行为。这种无监督行为的识别方法,不但揭示了动物行为的真实性,复杂性和丰富性;同时在空间和时间上客观的精确量化动物行为,提供了宝贵的突破性方法。
技术优势
- 无创、实时捕捉动物动作姿势和闭环反馈研究。效率高,大批量行为测试,可用于不同物种和不同类型的行为。
- 同时检测身体所有部位,包括细微的部位,如鼻子、关节和爪子等。
- 低延迟,高分辨。
- 不受检测竞技场的限制,如背景的混乱模糊,光线变化等;可以在笼具里直接观察动物的行为变化。
- 传递的行为学信息准确,丰富。
- 降低人为因素和主观偏见,增加行为解读的客观性和准确性。
服务内容
- 技术服务——委托测试与评价(符合IND药品注册申报标准)
- 系统集成——行为学研究技术的打包供应商(软件/硬件/行为学装置)
- 定制开发——各种动物(小鼠,大鼠,兔,犬,猪,猴等)其他行为学研究技术的定制与开发(软件/硬件/行为学装置,一站式开发)
目前已成熟的运用于五大类试验场景,13个小项,分别有:
测试科目 | 行为学测试目的 |
一、基本运动和感觉功能 | |
(1)旷场实验(Open field) | 测试动物的自主运动功能、探索、焦虑行为 |
(2)转棒实验(Rotarod) | 测试动物运动功能,检测评定运动协调和平衡、运动耐力、肌肉疲劳行为 |
(3)热疼痛测试Hotplate实验(痛觉) | 测试动物疼痛敏感度,疼痛机制研究及疼痛药物评价 |
二、学习和记忆 | |
(4)Morris水迷宫实验 | 测试动物空间记忆,学习记忆以及空间辨别能力 |
(5)物体识别实验 | 测试评估动物的认知和记忆能力 |
三、社会行为 | |
(6)群体接触/偏好实验 | 测试动物社交压力、情感缺陷,情绪导致的抑郁焦虑行为 |
四、焦虑性和抑郁性行为 | |
(7)强迫游泳实验 | 测试动物抑郁行为 |
(8)悬尾实验 | 测试动物抑郁行为 |
(9)高架十字迷宫实验 | 测试动物抗焦虑或致焦虑行为 |
(10)听觉惊吓实验 | 测试动物听刺激惊吓行为 |
五、奖赏行为 | |
(11)条件性位置偏爱实验 | 测试动物奖赏效应,偏好与厌恶回避行为 |
(12)糖水偏爱实验 | 测试动物情绪状态,喜好与抑郁行为 |
(13)自注射实验 | 测试动物奖赏情绪 |
- 项目需求
在慢性不可预知性温和应激模型(chronic unpredictable mild stress,CUMS)中,如何通过动物行为识别、界定焦虑应激和抑郁,从而判断模型的严重程度,对相应的受试药物进行准确评价。
- 解决方案
高速相机拍摄动物的行为视频;用小样本数据训练深度神经网络,然后自动、批量的分析视频数据,精确的跟踪标定的动物身体部位,稳健的提取动物的运动姿势和轨迹;精准识别动物模型的状态。
Step1. 通过行为实验,采集动物行为视频(.mp4);
Step2. 分析视频,得到行为数据(.xlsx);
Step3. 分析数据,提取参数(.xlsx);
Step4. 数据整合,解析,prism作图;
Step5. 结果汇总,完成报告(.word,.PPT);
- 数据展示

图. 强迫游泳实验,小鼠尾巴根部标记点轨迹坐标图(左);
不同组水中挣扎时间统计(右);

图. 悬尾实验,小鼠尾巴根部标记点摇摆轨迹坐标图(左);
不同组悬尾时挣扎时间统计(右)
案例讲解:CUMS模型小鼠在旷场强迫游泳实验和悬尾实验中,行为学数据的精准采集和对比分析,发现:Severe stress 小鼠的挣扎时间比SPF normal小鼠略微增加,精准识别Severe stress小鼠有焦虑应激行为,但没有到抑郁的严重程度。