行为学研究技术

深度学习的动物行为跟踪技术平台(DeepBhvTsTM)

Deep learning Animal Behavior tracking system(DeepBhvTsTM)

深度学习的动物行为跟踪技术平台

动物行为的描述和量化,是基础研究和转化研究的核心。由于动物行为本身的复杂性,观察技术的局限性以及人为评价的偏见性,对动物行为的解读带来了极大的挑战。如何客观、准确的量化动物的行为,解读实验动物的动机、本能和需求,成为问题的关键!

基于深度学习和机器视觉,可以高精度地对自由移动的实验动物,进行单个或多个身体部位的无标记跟踪。识别动物的姿势,检测和量化行为数据,客观的评价动物行为。这种无监督行为的识别方法,不但揭示了动物行为的真实性,复杂性和丰富性;同时在空间和时间上客观的精确量化动物行为,提供了宝贵的突破性方法。

技术优势

  • 无创、实时捕捉动物动作姿势和闭环反馈研究。效率高,大批量行为测试,可用于不同物种和不同类型的行为。
  • 同时检测身体所有部位,包括细微的部位,如鼻子、关节和爪子等。
  • 低延迟,高分辨。
  • 不受检测竞技场的限制,如背景的混乱模糊,光线变化等;可以在笼具里直接观察动物的行为变化。
  • 传递的行为学信息准确,丰富。
  • 降低人为因素和主观偏见,增加行为解读的客观性和准确性。

服务内容

  • 技术服务——委托测试与评价(符合IND药品注册申报标准)
  • 系统集成——行为学研究技术的打包供应商(软件/硬件/行为学装置)
  • 定制开发——各种动物(小鼠,大鼠,兔,犬,猪,猴等)其他行为学研究技术的定制与开发(软件/硬件/行为学装置,一站式开发)

目前已成熟的运用于五大类试验场景,13个小项,分别有:

测试科目

行为学测试目的

一、基本运动和感觉功能

(1)旷场实验(Open field)

测试动物的自主运动功能、探索、焦虑行为

(2)转棒实验(Rotarod)

测试动物运动功能,检测评定运动协调和平衡、运动耐力、肌肉疲劳行为

(3)热疼痛测试Hotplate实验(痛觉)

测试动物疼痛敏感度,疼痛机制研究及疼痛药物评价

二、学习和记忆

(4)Morris水迷宫实验

测试动物空间记忆,学习记忆以及空间辨别能力

(5)物体识别实验

测试评估动物的认知和记忆能力

三、社会行为

(6)群体接触/偏好实验

测试动物社交压力、情感缺陷,情绪导致的抑郁焦虑行为

四、焦虑性和抑郁性行为

(7)强迫游泳实验

测试动物抑郁行为

(8)悬尾实验

测试动物抑郁行为

(9)高架十字迷宫实验

测试动物抗焦虑或致焦虑行为

(10)听觉惊吓实验

测试动物听刺激惊吓行为

五、奖赏行为

(11)条件性位置偏爱实验

测试动物奖赏效应,偏好与厌恶回避行为

(12)糖水偏爱实验

测试动物情绪状态,喜好与抑郁行为

(13)自注射实验

测试动物奖赏情绪

  • 项目需求

在慢性不可预知性温和应激模型(chronic unpredictable mild stress,CUMS)中,如何通过动物行为识别、界定焦虑应激和抑郁,从而判断模型的严重程度,对相应的受试药物进行准确评价。

 

  • 解决方案

高速相机拍摄动物的行为视频;用小样本数据训练深度神经网络,然后自动、批量的分析视频数据,精确的跟踪标定的动物身体部位,稳健的提取动物的运动姿势和轨迹;精准识别动物模型的状态。

Step1. 通过行为实验,采集动物行为视频(.mp4);

Step2. 分析视频,得到行为数据(.xlsx);

Step3. 分析数据,提取参数(.xlsx);

Step4. 数据整合,解析,prism作图;

Step5. 结果汇总,完成报告(.word,.PPT);

 

  • 数据展示

图. 强迫游泳实验,小鼠尾巴根部标记点轨迹坐标图(左);

不同组水中挣扎时间统计(右);

图. 悬尾实验,小鼠尾巴根部标记点摇摆轨迹坐标图(左);

不同组悬尾时挣扎时间统计(右)

 

案例讲解:CUMS模型小鼠在旷场强迫游泳实验和悬尾实验中,行为学数据的精准采集和对比分析,发现:Severe stress 小鼠的挣扎时间比SPF normal小鼠略微增加,精准识别Severe stress小鼠有焦虑应激行为,但没有到抑郁的严重程度。